Bejaoui博士說："我們發現的多種和共享抗性基因表明艱難梭菌是一個抗菌素抗性基因庫，可以在動物和人類之間交換。這一令人震驚的發現表明，對抗生素的耐藥性可以比以前想象的更廣泛地傳播，并證實了從農場動物到人類的耐藥性鏈中的各個環節。"

艱難梭菌是一種感染人類腸道的細菌，除了三種當前的抗生素外，對所有的抗生素都有抗性。一些菌株含有允許它們產生毒素的基因，可以在腸道中引起破壞性的炎癥，導致威脅生命的腹瀉，主要發生在老年人和接受過抗生素治療的住院病人身上。

艱難梭菌被認為是美國最大的抗生素耐藥性威脅之一，僅2017年估計造成223900例感染和12800例死亡，醫療成本超過10億美元。

艱難梭菌的一種高致病性菌株（核糖型078；RT078）可引起更嚴重的疾病，其主要序列類型11（ST11），與社區中年輕和健康人的感染數量上升有關。農場動物最近被確定為RT078的載體。在這項研究中，丹麥科學家通過與丹麥醫院患者的臨床分離物進行比較，調查了艱難梭菌菌株在牲畜（豬）中的流行情況以及抗菌素耐藥基因在人畜共患中傳播的可能性。

在2020年和2021年之間，從丹麥各地的農場分兩批收集了514頭豬的糞便樣本。A批包括來自14個農場的330份母豬、仔豬和屠宰豬的樣本，在2020年。B批中的184個樣品是在2021年的屠宰過程中收集的。研究人員對樣本進行了艱難梭菌的篩查，并使用基因測序來確定它們是否攜帶毒素和耐藥基因。基因組測序還被用來比較豬樣本中的艱難梭菌分離物和同期從艱難梭菌感染患者身上收集的934個分離物。

在514份豬的樣本中，有54份有艱難梭菌的證據（A批=44，B批=9）。對40個樣本（A批=33，B批=7）的進一步分析發現，艱難梭菌在仔豬和母豬中比屠宰豬更常見。作者推測，這可能是由于仔豬和成年豬之間的年齡差異--年輕的豬的微生物群組成使它們更容易成功定植。

總的來說，在動物身上發現的13個序列類型與在病人的糞便樣本中發現的序列類型相匹配。ST11，一種動物相關的菌株，是最常見的（豬=21，人=270）。在16個案例中，人類和動物中的ST11菌株是相同的。所有來自動物的分離物的毒素基因都是陽性的，其中10個還具有超強的傳染性，具有更強的致病能力。

總的來說，來自動物的38個分離物至少含有一個抗性基因--而且總的來說，預測對七類抗生素有抗性，其中最常見的是大環內酯類、?-內酰胺類、氨基糖苷類和萬古霉素--這些都是治療嚴重細菌感染的重要藥物。

Bejaoui博士說："抗生素在人類醫學中的過度使用以及作為農場的廉價生產工具正在破壞我們治療細菌感染的能力。特別值得關注的是賦予氨基糖苷類藥物抗性的大量基因庫，艱難梭菌對這一類抗生素具有內在的抗性--它們在這個物種中不需要產生抗性。因此，艱難梭菌在向其他易感物種傳播這些基因方面發揮了作用。這項研究提供了更多的證據，證明在畜牧業中使用抗菌素所帶來的進化壓力，它選擇了具有危險性的人類病原體。這強調了采用更全面的方法來管理艱難梭菌感染的重要性，以便考慮所有可能的傳播途徑"。

盡管有這些重要的發現，但作者指出了幾個局限性，包括他們無法確定傳播的方向。正如Bejaoui博士所解釋的，"人類和動物分離物中的一些菌株是相同的，這表明它們可能是群體之間共享的，但在我們進行更深入的系統發育分析之前，我們無法確定傳播的方向，這也可能是雙向的，細菌在社區和農場中不斷交換和擴大"。